Osídluje chladné, čisté tekoucí vody s dostatkem kyslíku a pevným dnem (pstruhové pásmo), běžně se objevuje i v lipanovém pásmu a sestupuje až do horní části parmového pásma.
Geneticky rozdílné původní populace pstruha u nás již prakticky neexistují v důsledku více než sto let prováděných přesunů jiker a násad bez ohledu na původ matečných ryb.
Kromě toho byly jikry pstruha obecného několikrát dovezeny z různých částí Evropy a odchovaný plůdek porůznu vysazován.
K trvalému výskytu je důležitá dobrá kvalita vody, dostatečný obsah kyslíku a dále dostatek úkrytů.
Je známo, že pstruzi obsazují úseky řek pod některými údolními nádržemi, kde v důsledku změny teplotního režimu vznikají tzv. sekundární pstruhová pásma.
(Mořská forma na naše území už dlouho nevytahuje. Naproti tomu jezerní forma se v některých chladnějších údolních nádržích vyskytuje.)