Původní areál rozšíření jesetera sibiřského zahrnuje velké sibiřské řeky Ob, Irtyš, Jenisej, Lena, Kolyma, Chatanga, Pjasina, Anabar, Oleňok nebo Jana.
Vyskytuje se také v Bajkalském jezeře a jeho přítocích.
V roce 1996 k nám byly pokusně dovezeny jikry jesetera sibiřského z Ruska. Byl vyhodnocen jako velmi vhodný druh pro akvakulturu, rybniční podmínky a aklimatizaci v ČR.
Jesetera sibiřského chovají ve VÚRH ve Vodňanech a rybí líhni v Mydlovarech.
Vysazuje se v některých soukromých nádržích a do ostatních vod se může dostat únikem z uzavřených chovů, například vyplavením chovných nádrží při povodních, nebo při jejich výlovu.
Výskyt jesetera sibiřského na našem území zcela závisí na vysazování.
Ve středočeském svazovém revíru Písková Lhota (411 983) bylo v roce 2020 vysazeno cca 60 kusů jesetera ruského a sibiřského.