Bolen je rybou dolních a středních úseků velkých řek, vhodné podmínky nalezl i ve většině údolních nádržích.
V tekoucích vodách jej nacházíme v hlubších místech pod proudivými úseky, pod ústím menších přítoků, v klidné vodě v okolí padlých stromů, ve zcela klidné, ale i v tažné vodě.
V proudící vodě vyhledává proudové stíny za většími kameny, pilíři mostů i hlubší vodu v podjezí.
V údolních nádržích se zdržuje dále od břehů v blízkosti vodní hladiny. K břehům se přibližuje při lovu potravy.
Na zimu se stěhuje do hluboké vody výmolů, jam a tůní.